医院开设科室有肝病科、结核科、艾滋病科、心内科、呼吸内科、结核外科、外科、妇产科、关怀科、ICU、麻醉科、急诊科、综合门诊等科室，具有市医学重点学科―肝病专科、结核病专科、艾滋病专科。具有六个市级诊疗中心：艾滋病诊疗中心，结核病诊疗中心、肝病诊疗中心、传染病检测中心、姑息治疗中心、慢阻肺病诊疗中心；还是昆明市传染病诊疗中心，市医疗特色专科―重病人临终关怀科；院级特色专科―血稀生物平衡治疗专科。
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科室列表(共18个科室)更多
内科内分泌科(1)内一科（呼吸科）(2)内二科（心内科）(2)神经内科(1)内科(1)急诊科(2)
外科胸外科(1)外科(2)
妇儿妇产科(3)
其他肝病科(9)结核病科(9)关怀科(2)功能检查科(1)中医科(1)ICU(1)麻醉科(1)感染性疾病科(7)B超室(2)
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